After the entire surface of the sample has been imaged, an [[Ultramicrotome| ultramicrotome]] slices off the surface of the sample and the underlying surface is then imaged in the same way. The images from the scans of each successive layer of the sample were combined to form a 3D dataset.
시료의 표면이 전부 이미지화되면, 초박편제작기(ultramicrotome)가 시료의 표면을 얇게 걷어냅니다. 이렇게 새로 드러난 표면을 같은 방법으로 이미지화합니다. 스캔을 통해서 얻은 연속적인 시료의 층은 3D 데이터셋을 만들기 위해서 조합됩니다.