在EyeWire中，玩家将会得到一个称为“种子”的方块，而方块里横过一部分已经建模了的神经枝杈。在游戏界面右侧黑白相间的是神经的横切面图。玩家学着在单个神经分支的灰色边界里“着色”，这样的神经分支往往起于方块的某一面，一直延伸到相对的那面。这就能为一个方块的体积建好模型，一个分支接着一个分支。很多玩家去构建每一个方块的模型，然后和其他玩家比赛他们的成果。而高级玩家侦查兵 和 大刀,则能游览全球社区的成果。这些玩家有权去拓展分支以及除去 混在一起的神经。
